RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 TXNRD1Q16881 649 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 WLSQ5T9L3 541 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 KIFC2Q96AC6 838 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 IFNKQ9P0W0 207 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX1-201ENST00000265340 GNPATO15228 680 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CHMP4BP1P59074 171 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 WDR24Q96S15 920 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 GREM2Q9H772 168 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 RTN2O75298 545 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 GNG11P61952 73 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ETAA1Q9NY74 926 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PHACTR2O75167 634 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 RNF40O75150 1001 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CCT5P48643 541 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TAF5LO75529 589 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CLSTN1O94985 981 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 FNTAP49354 379 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.577e-7■■□□□ 12.9
PITX1-201ENST00000265340 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 SLC27A2O14975 620 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ADORA1P30542 326 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 DHX58Q96C10 678 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TUBBP07437 444 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CTSWP56202 376 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ISM2Q6H9L7 571 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CEP112Q8N8E3 955 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PNKPQ96T60 521 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ITGA6P23229 1130 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ME3Q16798 604 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 SH3GL3Q99963 347 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 FSBPO95073 299 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ICA1Q05084 483 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 IQCA1Q86XH1 822 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 MYH3P11055 1940 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 PLSCR1O15162 318 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 CUTAO60888 179 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP6O43182 974 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 DTNBO60941 627 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CD248Q9HCU0 757 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 FBXO3Q9UK99 471 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RREB1Q92766 1687 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 C4BP0C0L5 1744 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GUA9 196 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SUSD4Q5VX71 490 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CAMTA2O94983 1202 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KA4O75676 772 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 NECAB1Q8N987 351 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms