RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
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CASC3-201ENST00000264645 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.84■□□□□ 0.29
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CASC3-201ENST00000264645 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.84■□□□□ 0.29
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CASC3-201ENST00000264645 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
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CASC3-201ENST00000264645 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.83■□□□□ 0.29
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CASC3-201ENST00000264645 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
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CASC3-201ENST00000264645 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.83■□□□□ 0.28
CASC3-201ENST00000264645 SRGAP2O75044 1071 aa16.82■□□□□ 0.28
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CASC3-201ENST00000264645 SWAP70Q9UH65 585 aa16.82■□□□□ 0.28
CASC3-201ENST00000264645 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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