RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 WNT7AO00755 349 aa22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPREP23469 700 aa22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.1■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 USP17L21D6R901 530 aa22.1■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF827Q17R98 1081 aa22.1■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.1■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 PTPN14Q15678 1187 aa22.09■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM232C9JQI7 657 aa22.09■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 MYL5Q02045 173 aa22.09■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.08■■□□□ 1.13
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM182BQ5T319 152 aa22.08■■□□□ 1.13
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LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1B0GUL6 1792 aa22.06■■□□□ 1.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 ADAMTS3O15072 1205 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 CASP1P29466 404 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 RCAN1P53805 252 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 INTS13Q9NVM9 706 aa22.05■■□□□ 1.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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LPCAT3-201ENST00000261407 NLRP3Q96P20 1036 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 SETDB2Q96T68 719 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 MYH6P13533 1939 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.03■■□□□ 1.12
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