RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 CDC6Q99741 560 aa7.89□□□□□ -1.15
MDM2-201ENST00000258148 ADAM19Q9H013 955 aa7.89□□□□□ -1.15
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MDM2-201ENST00000258148 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.88□□□□□ -1.15
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MDM2-201ENST00000258148 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
MDM2-201ENST00000258148 BRD3Q15059 726 aa7.84□□□□□ -1.15
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MDM2-201ENST00000258148 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.84□□□□□ -1.16
MDM2-201ENST00000258148 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.84□□□□□ -1.16
MDM2-201ENST00000258148 PASD1Q8IV76 773 aa7.84□□□□□ -1.16
MDM2-201ENST00000258148 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.84□□□□□ -1.16
MDM2-201ENST00000258148 LGR4Q9BXB1 951 aa7.84□□□□□ -1.16
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