RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.2■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 NEDD4P46934 1319 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 B4E1Z4 1266 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SRGNP10124 158 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CCDC66A2RUB6 948 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 TRDNQ13061 729 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 GGA1Q9UJY5 639 aa23.19■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 GNAT2P19087 354 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 YEATS4O95619 227 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 NLRP12P59046 1061 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 GRIK5Q16478 980 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 FBXO41Q8TF61 875 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SLC15A2Q16348 729 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CLIC4Q9Y696 253 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ATP2B4P23634 1241 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 FAM193AP78312 1265 aa23.17■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 C6orf229H3BNL8 230 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SPTLC2O15270 562 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CCP110O43303 1012 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CCDC93Q567U6 631 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 C8orf76Q96K31 380 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 BIN1O00499 593 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CD209Q9NNX6 404 aa23.16■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 HOMER1Q86YM7 354 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 SENP2Q9HC62 589 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 ZMYM6O95789 1325 aa23.15■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 BRAPQ7Z569 592 aa23.14■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 FBXL16Q8N461 479 aa23.14■■□□□ 1.3
VGF-201ENST00000249330 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.14■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ZNF202O95125 648 aa23.14■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 TOMM22Q9NS69 142 aa23.14■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.14■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 RIMBP2O15034 1052 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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VGF-201ENST00000249330 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 NPR1P16066 1061 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 PDE6BP35913 854 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 EVCP57679 992 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 FANCCQ00597 558 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 NCAPHQ15003 741 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.13■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 EVX2Q03828 476 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ST7Q9NRC1 585 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 CLCN6P51797 869 aa23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 PPARAQ07869 468 aa23.12■■□□□ 1.29
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VGF-201ENST00000249330 IKBKBO14920 756 aa23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.11■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 PFKFB1P16118 471 aa23.1■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 RXRAP19793 462 aa23.1■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.1■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 DNAI1Q9UI46 699 aa23.1■■□□□ 1.29
VGF-201ENST00000249330 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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