RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 TIGD1Q96MW7 591 aa9.52□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.52□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TSPY2A6NKD2 308 aa9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 BTBD18B2RXH4 712 aa9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 BAG3O95817 575 aa9.52□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 PTPAQ15257 358 aa9.52□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.52□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 MAP3K14Q99558 947 aa9.52□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 TPM2P07951 284 aa9.51□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.51□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 RESP18Q5W5W9 173 aa9.51□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.51□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 KIF5BP33176 963 aa9.5□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 NLRP12P59046 1061 aa9.5□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 TROAPQ12815 778 aa9.5□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 CRY2Q49AN0 593 aa9.5□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.49□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 SMTNL1A8MU46 457 aa9.49□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 CYP2D6P10635 497 aa9.49□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.49□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.49□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 A0A087WWV3 80 aa9.48□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 BBOX1O75936 387 aa9.48□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.48□□□□□ -0.89
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VAMP3-201ENST00000054666 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 CABP5Q9NP86 173 aa9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 ATP2B1P20020 1258 aa9.48□□□□□ -0.89
VAMP3-201ENST00000054666 PTPREP23469 700 aa9.48□□□□□ -0.89
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