RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 CnpP16330 420 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npr3P70180 536 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 LdhdQ7TNG8 484 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bicd2Q921C5 820 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem47Q9JJG6 181 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ly6iQ9WU67 134 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casz1Q9CWL2 1761 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k9Q3U1V8 1077 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scaf8Q6DID3 1268 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnj14Q8JZN3 434 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim59Q922Y2 403 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stk39Q9Z1W9 556 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Llgl2Q3TJ91 1027 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ckap2Q3V1H1 664 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glra4Q61603 456 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sirt2Q8VDQ8 389 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Borcs6Q9D6W8 360 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sel1lQ9Z2G6 790 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cap1P40124 474 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 GmpsQ3THK7 693 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb39Q6PDK0 712 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbed3Q9D0L1 228 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mei1Q9D4I2 1268 aa13.61□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col4a5Q63ZW6 1691 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 GnaqP21279 359 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm4P49717 862 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr93Q402B2 695 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp317Q8C0Q5 607 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trappc12Q8K2L8 797 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmym2Q9CU65 1376 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nup188Q6ZQH8 1759 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptpn12P35831 775 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 NyxP83503 476 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kmt5bQ3U8K7 883 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr162Q3UN16 588 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kbtbd13Q8C828 458 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stk38Q91VJ4 465 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfcp2Q9ERA0 502 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh2G3UW82 1942 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Larp6Q8BN59 492 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eid1Q9DCR4 169 aa13.6□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Copb2O55029 905 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 MycnP03966 462 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Qrich1Q3UA37 777 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mad2l2Q9D752 211 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ildr2B5TVM2 661 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scnn1aQ61180 699 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc8Q6PGF7 716 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igbp1bQ9QZ29 343 aa13.59□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stag2O35638 1231 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem39bQ810L4 492 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mknk2Q8CDB0 459 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naa30Q8CES0 364 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 DpydQ8CHR6 1025 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Galntl5Q9D4M9 431 aa13.58□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vcam1P29533 739 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnt10bP48614 389 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psen2Q61144 448 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll1Q91V51 423 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr4Q91XS1 1190 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpaa1Q9WTK3 621 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akap2O54931 893 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc27a1Q60714 646 aa13.58□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 StrcQ8VIM6 1809 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 UncxO08934 530 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 LdhaP06151 332 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armc2Q3URY6 854 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Samm50Q8BGH2 469 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plcd1Q8R3B1 756 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr19Q3UGF1 1341 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtmaP26350 111 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sept2P42208 361 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sap30bpQ02614 308 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myt1Q8CFC2 1127 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lman1lQ8VCD3 505 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcan1Q9JHG6 198 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnip1Q9WUU8 647 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs12Q8CGE9 1381 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btaf1E9QAE3 1848 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2hP62257 183 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf697Q569E7 569 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfap4Q9JIZ5 338 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa13.57□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 CfhP06909 1234 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif4P33174 1231 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76 ms