RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defa27F2Z403 93 aa13,95□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 U90926O08546 118 aa13,95□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BaalcQ8VHV1 145 aa13,95□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10570F6VB42 170 aa13,94□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa13,93□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm17521F6QAC8 156 aa13,93□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam104aA2A6P4 185 aa13,92□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube2bP63147 152 aa13,92□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnah6E9Q0B6 4144 aa13,91□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm7137J3QMW1 236 aa13,91□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb40Q70KL2 73 aa13,9□□□□□ -0,18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spink8Q09TK9 105 aa13,88□□□□□ -0,19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa13,88□□□□□ -0,19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dph3Q8K0W9 82 aa13,86□□□□□ -0,19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa13,86□□□□□ -0,19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP13,85□□□□□ -0,19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Coa6Q8BGD8 79 aa13,82□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 B9d2Q3UK10 175 aa13,82□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa13,81□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AW011738F6S7Q2 159 aa13,8□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa13,8□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defa28D3Z1V9 94 aa13,8□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm21886J3QJU9 214 aa13,78□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 VwfQ8CIZ8 2813 aa13,78□□□□□ -0,2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zcchc13Q9D548 170 aa13,77□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10337F7DEP7 55 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10139O88245 57 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Odf3bQ5M8M2 238 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spint4Q9D263 159 aa13,76□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SycnQ8VCK7 134 aa13,75□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TgO08710 2766 aa13,74□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chchd10Q7TNL9 138 aa13,72□□□□□ -0,21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa13,7□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa13,7□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa13,68□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mrpl55Q9CZ83 127 aa13,67□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Reg3aO09037 175 aa13,66□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Csmd3Q80T79 3707 aa13,66□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dync2h1Q45VK7 4306 aa13,65□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10837Q3UTT8 145 aa13,65□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AI606181Q8C7B9 129 aa13,65□□□□□ -0,22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 H2al1bA0A087WP11 105 aa13,64□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 H2al1kJ3QP08 105 aa13,64□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 H2al1eQ810S6 105 aa13,64□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 H2al1mQ9DAD9 105 aa13,64□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atox1O08997 68 aaKnown RBP13,64□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP13,63□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfdc10Q3V2J9 124 aa13,62□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spata3Q9D9T6 193 aa13,62□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube2aQ9Z255 152 aa13,62□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A286YE49 62 aa13,62□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Coa5Q99M07 74 aa13,59□□□□□ -0,23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm20604F8WIA3 75 aa13,58□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb12Q8K4N3 78 aa13,58□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa13,56□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnah11E9Q7N9 4488 aa13,55□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb10Q8R2I8 73 aa13,55□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa13,54□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10197F6QEY5 67 aa13,54□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl37aP61514 92 aa13,54□□□□□ -0,24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnah9B1AR51 4484 aa13,51□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm2310J3QNJ2 377 aa13,51□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa13,51□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HrnrQ8VHD8 2496 aa13,51□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP13,48□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb9Q8R2I6 67 aa13,48□□□□□ -0,25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Megf8P60882 2789 aa13,45□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa13,44□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8K1L6 76 aa13,44□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm27235Q3UW50 83 aa13,44□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nupr2Q497P3 102 aa13,44□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa13,43□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa13,43□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tenm2Q9WTS5 2764 aa13,42□□□□□ -0,26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TnxbO35452 4006 aa13,39□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igsf10Q3V1M1 2594 aa13,36□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10065F6TJM2 114 aa13,35□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm17349F7BGH6 99 aa13,35□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Muc6Q80T03 2850 aa13,34□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stab2Q8R4U0 2559 aa13,34□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bean1Q9EQG5 255 aa13,33□□□□□ -0,27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chtf8P0CG14 533 aa13,32□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10642Q3TWM1 71 aa13,31□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fras1Q80T14 4010 aa13,3□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FasnP19096 2504 aaKnown RBP13,3□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap29-1A2A5X4 342 aa13,28□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phxr4P15974 95 aa13,27□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plac8Q9JI48 112 aa13,27□□□□□ -0,28
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm4707V9GXN5 68 aa13,27□□□□□ -0,29
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10267M0QWD8 85 aa13,25□□□□□ -0,29
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP13,23□□□□□ -0,29
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sox16Q62247 57 aa13,2□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4933415A04RikQ9D443 101 aa13,17□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PrkdcP97313 4128 aa13,16□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10160F6Y577 67 aa13,16□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cypt14J3QPF7 87 aa13,16□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa13,15□□□□□ -0,3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP13,14□□□□□ -0,31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44,6 ms