RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa6.58□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ufsp1Q9CZP0 217 aa6.58□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ormdl1Q921I0 153 aa6.58□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Camk2n2Q78WH7 79 aa6.58□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nf1Q04690 2841 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 A0A286YCN5 57 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cox7b2Q9D2H1 82 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tep1P97499 2629 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Svep1A2AVA0 3567 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CrygdP04342 174 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CrygeQ03740 174 aa6.57□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 EnhoQ8K1D8 76 aa6.56□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GhrhP16043 103 aa6.56□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defa27F2Z403 93 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm17577J3QNF7 156 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MobpQ9D2P8 170 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defa28D3Z1V9 94 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10735Q3US96 136 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SvipQ3UZP4 77 aa6.55□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10845Q3UNY9 185 aa6.54□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Odf3l2Q3TZ65 277 aa6.54□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gpha2Q925Q5 128 aa6.54□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lypd5Q9D7Z7 256 aa6.54□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm11565A2A4M7 156 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm26661M0QWV4 156 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tcl1b3P56842 122 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Celsr2Q9R0M0 2920 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Samd13D3YUG0 102 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm9805F6YK59 57 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10772F7AIG4 85 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krtap24-1G3X9A2 248 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BikO70337 150 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serp2Q6TAW2 65 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Notch1Q01705 2531 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube2d4D3YUH6 135 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Brk1Q91VR8 75 aa6.53□□□□□ -1.36
Clstn3-201ENSMUST00000008297 E130114P18RikF6S0S7 154 aa6.52□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 A0A286YE02 88 aa6.52□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa6.51□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LrbaQ9ESE1 2856 aa6.51□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CicQ924A2 2510 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam19a1Q7TPG8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 9430015G10RikA2ASP7 199 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5153P01627 120 aa6.5□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa6.49□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ScxQ64124 207 aa6.48□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defb50Q6TU36 73 aa6.48□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa6.48□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pet100P0DJE0 76 aa6.47□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa6.47□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Muc4Q8JZM8 3443 aa6.47□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cmya5Q70KF4 3739 aa6.47□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa6.47□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa6.46□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm3233E9Q2H5 230 aa6.46□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Akap13E9Q394 2776 aa6.46□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa6.46□□□□□ -1.37
Clstn3-201ENSMUST00000008297 9530003J23RikQ8BM26 151 aa6.46□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa6.45□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cox7bP56393 80 aa6.45□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube2bP63147 152 aa6.45□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stab1Q8R4Y4 2571 aa6.45□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem258P61166 79 aa6.45□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9DAA7 145 aa6.44□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa6.43□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa6.43□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tcl1b5P56845 121 aa6.43□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa6.43□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pde6gP09174 87 aa6.43□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mast4Q811L6 2618 aa6.42□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mrpl55Q9CZ83 127 aa6.42□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa6.41□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa6.41□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klk9Q32M27 251 aa6.41□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defb37Q7TMD2 62 aa6.41□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Csdc2Q91YQ3 154 aa6.41□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa6.4□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa6.4□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defb12Q8K4N3 78 aa6.4□□□□□ -1.38
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr15lQ8JZM2 100 aa6.4□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ntn5Q3UQ22 452 aa6.4□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm9903Q8C9Y8 129 aa6.4□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kmt2bO08550 2713 aa6.39□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa6.39□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa6.39□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01819 144 aa6.39□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ndufc1Q9CQY9 76 aa6.38□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa6.38□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SnurfQ9WU12 71 aa6.38□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm17509Q9CZ61 145 aa6.38□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Msrb1Q9JLC3 116 aa6.38□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa6.37□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa6.37□□□□□ -1.39
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.7 ms