RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MturnQ8CGA4 131 aa7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PpdpfQ9CR37 115 aa7.88□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vps13dB1ART2 4390 aa7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 LeprotO89013 131 aa7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm5617Q91VN2 117 aa7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defa9P50707 93 aa7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 SpinklQ8CEK3 90 aa7.87□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nupr2Q497P3 102 aa7.86□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dppa2Q9CWH0 301 aa7.86□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fgf6P21658 208 aa7.86□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Wfdc3Q14AE4 130 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ss18l2Q9D174 77 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hspb8Q9JK92 196 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gpx1P11352 201 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn1r197Q8R265 298 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem97Q8VD00 176 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mfap4Q9D1H9 257 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Smim13E9Q942 88 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm10604Q3V0X7 143 aa7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P01896 185 aa7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defa1P11477 93 aa7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gnb1lQ9EQ15 326 aa7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dnah2P0C6F1 4456 aa7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defa16P50714 93 aa7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Krtap10-4Q08EG8 221 aa7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 9430069I07RikQ9CX21 111 aa7.84□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem238A9JSM3 176 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ndufa1O35683 70 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defa13P50711 93 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pxt1Q8K459 51 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mustn1Q99JI1 82 aa7.83□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm4064A0A087WR82 380 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm10352B2RWR6 380 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rbmy1a1O35698 380 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rbmy1bQ60990 380 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Foxi2Q3I5G5 311 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gatd1Q8BFQ8 220 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prss58Q8BW11 241 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fgf23Q9EPC2 251 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zfand2aQ9JII7 171 aa7.82□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam240aJ3QNP9 97 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mtatp8P03930 67 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 BaalcQ8VHV1 145 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P01823 113 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defb40Q70KL2 73 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ndufc2Q9CQ54 120 aa7.81□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ryr3A2AGL3 4863 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trav8-1A0A075B641 109 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plac8Q9JI48 112 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pkd1O08852 4293 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P01837 106 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bsph2Q0Q236 131 aa7.8□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ociad2Q9D8W7 154 aa7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa7.78□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa7.78□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PscaP57096 123 aa7.78□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cks1brtQ3UNC9 96 aa7.78□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm26602M0QWA4 95 aa7.77□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CnbpP53996 178 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ube2wQ8VDW4 151 aa7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cby1Q9D1C2 127 aa7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Erg28Q9ERY9 140 aa7.77□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm20730A0A075B5J6 119 aa7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm28374F6SG70 93 aa7.76□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm9242J3QNY1 357 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem86bQ497J1 226 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm29289A0A087WPY7 166 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm42674D3YUT9 64 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 S100a8P27005 89 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam240bJ3QMB3 78 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cks1bP61025 79 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defb50Q6TU36 73 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cox7b2Q9D2H1 82 aa7.75□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm10837Q3UTT8 145 aa7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prelid3aQ8VE85 172 aa7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gtf2h5Q8K2X8 71 aa7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm26920S4R2A5 56 aa7.74□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cox8cA6H666 72 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P01755 137 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 SrarpQ3ULG3 163 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sprr4Q8CGN8 76 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hrct1Q9D6B9 109 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plac1Q9JI83 173 aa7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rmi2Q3UPE3 149 aa7.71□□□□□ -1.18
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.3 ms