RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 9430015G10RikA2ASP7 199 aa8.83□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm17521F6QAC8 156 aa8.83□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fam19a5Q91WE9 132 aa8.82□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa8.82□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 P0C913 63 aa8.82□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm12689Q8BQU9 117 aa8.82□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10401E9Q3K6 71 aa8.82□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf239P24399 201 aa8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ncoa6Q9JL19 2067 aa8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 C1qcQ02105 246 aa8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcnx3Q8VI59 2028 aa8.81□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 9530003J23RikQ8BM26 151 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5629P06327 117 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 FcorP0DJI6 106 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 TshbP12656 138 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Spink8Q09TK9 105 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa8.8□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 CdsnQ7TPC1 561 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 SetxA2AKX3 2646 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-61P01749 117 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp5eP56382 52 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vpreb3D3Z6J4 130 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Naa38Q9D2U5 125 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Chchd7Q8K2Q5 85 aa8.79□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa8.78□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ormdl1Q921I0 153 aa8.78□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Triap1Q9D8Z2 76 aa8.78□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defb12Q8K4N3 78 aa8.78□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rnf185Q91YT2 192 aa8.78□□□□□ -1
Ctif-201ENSMUST00000165559 P18527 97 aa8.77□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fgf23Q9EPC2 251 aa8.77□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm6899Q3USS0 134 aa8.76□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 1700056E22RikF7CNM6 234 aa8.76□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defb42Q8BVB5 75 aa8.76□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm26602M0QWA4 95 aa8.76□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Obox2E9PXV9 151 aa8.76□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem213Q08EA8 116 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cox8cA6H666 72 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 SycnQ8VCK7 134 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 SptssbQ925E8 76 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 BC067074F6RXI4 2391 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defb13Q8R2I4 64 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Spink4O35679 86 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 P06329 120 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wfdc10Q3V2J9 124 aa8.75□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ovol3D3YYM0 189 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem254aP0DN89 123 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem254bP0DN90 123 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem254cP0DN91 123 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rbx1P62878 108 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nav2E9Q842 2432 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10490F6VBM2 120 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9805F6YK59 57 aa8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 LhbO09108 141 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ndufc1Q9CQY9 76 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5464Q3UY29 175 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Srsf12Q8C8K3 266 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Timm17bQ9Z0V7 172 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9922Q8C3P1 144 aa8.73□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-72P01751 139 aa8.72□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cox7bP56393 80 aa8.72□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa8.72□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa8.72□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Q8K1L6 76 aa8.71□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tcl1b5P56845 121 aa8.71□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa8.71□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcnx2Q5DU28 2122 aa8.71□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 A0A286YCN5 57 aa8.71□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ly6hQ9WUC3 139 aa8.71□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tanc2A2A690 1994 aa8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 DysfQ9ESD7 2090 aa8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ube2d4D3YUH6 135 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 BC107364E9Q5A2 140 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 A930009A15RikG3UYI6 118 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01755 137 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gpha2Q925Q5 128 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm20604F8WIA3 75 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 PcntP48725 2898 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Psmb11Q8BG41 302 aa8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Brk1Q91VR8 75 aa8.68□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wfdc12Q9JHY3 85 aa8.68□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa8.68□□□□□ -1.02
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm16223Q8CBM3 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.2 ms