RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29423A0A087WRM1 55 aa9.11□□□□□ -0.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700020N15RikL7MTX3 112 aa9.11□□□□□ -0.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl32-psP17932 135 aa9.11□□□□□ -0.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa9.11□□□□□ -0.95
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa9.1□□□□□ -0.95
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igsf10Q3V1M1 2594 aa9.06□□□□□ -0.96
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa9.04□□□□□ -0.96
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GalmQ8K157 342 aa9.04□□□□□ -0.96
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr38Q9D994 303 aa9.04□□□□□ -0.96
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa9.03□□□□□ -0.96
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trdv5A0A075B661 115 aa9.03□□□□□ -0.96
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap16-1A2A5X5 502 aa9.01□□□□□ -0.97
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf740Q6NZQ6 180 aa9□□□□□ -0.97
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem101Q91VP7 257 aa9□□□□□ -0.97
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa8.99□□□□□ -0.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10322F7D7I4 111 aa8.99□□□□□ -0.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrygfQ9CXV3 174 aa8.99□□□□□ -0.97
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6hQ9WUC3 139 aa8.97□□□□□ -0.97
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa2Q8QZV2 295 aa8.96□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufa3Q9CQ91 84 aa8.96□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4ebp1Q60876 117 aa8.96□□□□□ -0.98
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phpt1Q9DAK9 124 aa8.94□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox17P56394 63 aa8.94□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01729 129 aa8.93□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa1P11477 93 aa8.93□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pglyrp4Q0VB07 374 aa8.92□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa8.92□□□□□ -0.98
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CirbpP60824 172 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm17bQ9Z0V7 172 aa8.92□□□□□ -0.98
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