RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Runx1Q03347 451 aa16.07■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 LystP97412 3788 aa16.07■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AcacbE9Q4Z2 2448 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defa-rs7P50715 91 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il1f10Q8R459 152 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyyr1Q8VIH7 165 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abca2P41234 2434 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm28044L7N1X0 119 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccl24Q9JKC0 119 aa16.06■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 LrbaQ9ESE1 2856 aa16.05■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm29666A0A087WQ99 126 aa16.05■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mrpl35Q9CQL6 188 aa16.05■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klhdc1Q80YG3 406 aa16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem263Q9DAM7 115 aa16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube2e2Q91W82 201 aa16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Synj2bpQ9D6K5 145 aa16.04■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10490F6VBM2 120 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Insl3O09107 122 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psmb8P28063 276 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb18Q30KP5 85 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam19a4Q7TPG5 135 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Muc4Q8JZM8 3443 aa16.03■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa16.02■□□□□ 0.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NpwA0A1L1STR8 176 aa16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fhl2O70433 279 aa16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CckP09240 115 aa16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndufs7Q9DC70 224 aa16.02■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm933J3QPC1 141 aa16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa16.01■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kmt2bO08550 2713 aa16■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp5lQ9CPQ8 103 aa16■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Morn5Q9DAI9 170 aa16■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 OtogO55225 2910 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 OdaphJ3QNT8 126 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Samd5Q3V1H9 173 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm28269A0A087WSG3 125 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm21748Q3UE70 102 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srsf12Q8C8K3 266 aa15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10509O88255 85 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lect2O88803 151 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01811 117 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdip1Q9DB75 208 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ly86O88188 162 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap126Q6P8X9 189 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BC106179Q8C9L1 186 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mfap4Q9D1H9 257 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rab37Q9JKM7 223 aa15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cox17P56394 63 aa15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm6793B2RXM2 351 aa15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gatd1Q8BFQ8 220 aa15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ep300B2RWS6 2412 aa15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HampQ9EQ21 83 aa15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 March3Q8BRX9 218 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Reg3gO09049 174 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifitm10Q8BR26 201 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AY761184Q9D848 116 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phlda3Q9WV95 125 aa15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Esp24A8R0V6 68 aa15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gata1P17679 413 aa15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfc1P97766 202 aa15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcp4P63054 62 aa15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NbasE9Q411 2356 aa15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AngP21570 145 aa15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ly6gP35461 111 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spata45Q9CVW4 97 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cryba4Q9JJV0 196 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl32-psP17932 135 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P84751 237 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ang3P97802 145 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifi27l2aQ8R412 90 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01896 185 aa15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ighv1-72P01751 139 aa15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm9936Q8C864 160 aa15.9■□□□□ 0.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klk1b4P00757 256 aa15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ucn2Q99ML8 113 aa15.89■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10322F7D7I4 111 aa15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm9887F6RFI0 207 aa15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930470P17RikQ9D542 155 aa15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01786 117 aa15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf152Q8BG47 203 aa15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm9913Q8BQQ2 135 aa15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbmy1bQ60990 380 aa15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam110dQ80X91 271 aa15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lgals4Q8K419 326 aa15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10135F6TEE5 83 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 77.5 ms