RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MtorQ9JLN9 2549 aa7.05□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lyzl4Q9D925 145 aa7.05□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1810032O08RikE9PZV8 113 aa7.05□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm17455G3UW87 128 aa7.05□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm20730A0A075B5J6 119 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rpl32-psP17932 135 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam19a4Q7TPG5 135 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem263Q9DAM7 115 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rpl35aO55142 110 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01738 130 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klk1b4P00757 256 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01896 185 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 C1qcQ02105 246 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ndufs7Q9DC70 224 aa7.04□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spink13Q3UTS8 97 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01802 115 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10767Q3TQP0 103 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mrpl35Q9CQL6 188 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rmi2Q3UPE3 149 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klk5Q9D140 293 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cryba4Q9JJV0 196 aa7.03□□□□□ -1.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LhbO09108 141 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hoxd3P09027 433 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defa1P11477 93 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Samd5Q3V1H9 173 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zzef1Q5SSH7 2924 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SrarpQ3ULG3 163 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Phpt1Q9DAK9 124 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10226O88253 85 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 H1fxQ80ZM5 188 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Timm17aQ9Z0V8 171 aa7.02□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Socs3O35718 225 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LeprotO89013 131 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spink12Q9D256 87 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hivep2Q3UHF7 2430 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 FcorP0DJI6 106 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Odf1Q61999 247 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Crip3Q6Q6R3 243 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Setd2E9Q5F9 2537 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9D8Q6 235 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myo18bE9PV66 2605 aa7.01□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vps13cQ8BX70 3748 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hivep3A2A884 2348 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm6793B2RXM2 351 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5089A1L3C8 106 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccl21aP84444 133 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccl21bP86792 133 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccl21cP86793 133 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il19Q8CJ70 176 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf183Q8QZS5 190 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam216aQ9DB54 251 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Akap9Q70FJ1 3797 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv2-3A0A075B696 115 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cops9Q3U898 57 aa7□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm7257D3YX25 99 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav13d-1A0A075B606 110 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf740Q6NZQ6 180 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SpinklQ8CEK3 90 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tomm7Q9D173 55 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dnal4Q9DCM4 105 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Morn5Q9DAI9 170 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa6.99□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 D130052B06RikQ3UW13 202 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Polr2kQ63871 58 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zc2hc1bQ9D534 172 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nbeal1E9PYP2 2688 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam222aQ6PGH4 453 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr9Q8BV84 116 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube2wQ8VDW4 151 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ifitm1Q9D103 106 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prp2P05143 317 aa6.98□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gcn1E9PVA8 2671 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930470P17RikQ9D542 155 aa6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9DAQ5 155 aa6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfhx3Q61329 3726 aa6.97□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav7-6A0A075B640 112 aa6.96□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm21748Q3UE70 102 aa6.96□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbmy1bQ60990 380 aa6.96□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 March3Q8BRX9 218 aa6.96□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RetnQ99P87 114 aa6.96□□□□□ -1.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 C2cd3Q52KB6 2323 aa6.96□□□□□ -1.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cox8cA6H666 72 aa6.96□□□□□ -1.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp6v0e2Q91XE7 81 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41 ms