RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.63■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 FAM196BA6NMK8 535 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 APPP05067 770 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 HLA-DOAP06340 250 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CYP2D6P10635 497 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 GNAT2P19087 354 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CHMLP26374 656 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 EVX2Q03828 476 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K11Q16584 847 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 WRNIP1Q96S55 665 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 PLCD1P51178 756 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 SOX10P56693 466 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 VPS53Q5VIR6 699 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 TTC6Q86TZ1 520 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 ZIC5Q96T25 663 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 USP17L12C9JPN9 530 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 USP17L21D6R901 530 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 TDO2P48775 406 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 IL25Q9H293 177 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN6-218ENST00000637223 FOXP2O15409 715 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 TBC1D12O60347 775 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 INPP5BP32019 993 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K9P80192 1104 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K10Q02779 954 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 RGMBQ6NW40 437 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 CTR9Q6PD62 1173 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 DNAJC18Q9H819 358 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 FOCADQ5VW36 1801 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SMIM22K7EJ46 135 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 NOGQ13253 232 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 VGLL4Q14135 290 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 C12orf60Q5U649 245 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 NAPBQ9H115 298 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 EHD4Q9H223 541 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 ELP3Q9H9T3 547 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 CSADQ9Y600 493 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 AK9Q5TCS8 1911 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 RAD50Q92878 1312 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 CDC45O75419 566 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SBK1Q52WX2 424 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 UNCXA6NJT0 531 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SGSM2O43147 1006 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 GABPAQ06546 454 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 SIPA1L1O43166 1804 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN6-218ENST00000637223 FGAP02671 866 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN6-218ENST00000637223 SLC10A3P09131 477 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms