RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-215ENST00000635899 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 RAI14Q9P0K7 980 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 PNMA3Q9UL41 463 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 GJB1P08034 283 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 MCAMP43121 646 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 FLT3LGP49771 235 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 HMGCS2P54868 508 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 RHBDL3P58872 404 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 TIMM10P62072 90 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 GSTO1P78417 241 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 MTX1Q13505 466 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 TEX11Q8IYF3 940 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 SPATA5Q8NB90 893 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 ZNF384Q8TF68 577 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 COA7Q96BR5 231 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 HMG20BQ9P0W2 317 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 TNNQ9UQP3 1299 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.53□□□□□ -1.52
CREBBP-215ENST00000635899 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 FLT1P17948 1338 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 EVI5O60447 810 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 GDF11O95390 407 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 HMGCRP04035 888 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TRIM27P14373 513 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 MTMR2Q13614 643 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 DEFB118Q96PH6 123 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 MYH7BA7E2Y1 1941 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SCN5AQ14524 2016 aa5.52□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PTPRSQ13332 1948 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 MYO9BQ13459 2157 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 ZBTB22O15209 634 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SGPL1O95470 568 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 GNAI2P04899 355 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 LDHCP07864 332 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 CAP2P40123 477 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SPP2Q13103 211 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 IRF5Q13568 498 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 DNAJC18Q9H819 358 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 SNRKQ9NRH2 765 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.51□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 USP17L5A8MUK1 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TBC1D12O60347 775 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 PEX10O60683 326 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 BCAR3O75815 825 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 HLA-DOAP06340 250 aa5.5□□□□□ -1.53
CREBBP-215ENST00000635899 ASNSP08243 561 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms