RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ITGA6	P23229	1130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GRM5	P41594	1212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	NR3C2	P08235	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PHKG2	P15735	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	RLF	Q13129	1914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PSMD14	O00487	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	IGFBP4	P22692	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	INHBE	P58166	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ST5	P78524	1137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	IRF6	O14896	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ELN	P15502	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	DPF2	Q92785	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ERC2	O15083	957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SPINT1	O43278	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	INHA	P05111	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	UBXN2A	P68543	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TNIP1	Q15025	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	COL4A1	P02462	1669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	NPHP1	O15259	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	FDX1	P10109	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ITGAE	P38570	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	AMPH	P49418	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	EPHB4	P54760	987 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PRMT2	P55345	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583		Q6ZVU0	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583		A0A1W2PP64	1363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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