RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEA1	P43355	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXO3	O43524	673 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ERCC3	P19447	782 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP7A1	P22680	504 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RAD50	Q92878	1312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF174	Q15697	407 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TRAF5	O00463	557 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NR1I2	O75469	434 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCT5	P48643	541 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	IDI1	Q13907	227 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC27A2	O14975	620 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NAPA	P54920	295 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PAK2	Q13177	524 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP104	O60308	925 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CALML3	P27482	149 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NLRP12	P59046	1061 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	STAM	Q92783	540 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF131	P52739	623 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	G2E3	Q7L622	706 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM14	Q14142	442 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT2	P35908	639 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	GNAQ	P50148	359 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP7B	P35670	1465 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	VCX	Q9H320	206 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CPS1	P31327	1500 aa		13.08	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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