RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621870.4

GGA3-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 1 (best)

Gene GGA3, Length 4,034 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-223	ENST00000621870	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SPAG1	Q07617	926 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	UBXN4	Q92575	508 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CAVIN2	O95810	425 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FLOT1	O75955	427 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PTGS1	P23219	599 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	HSPA4	P34932	840 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GRAP	Q13588	217 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	KLRF2	D3W0D1	207 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FAM193A	P78312	1265 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PIM2	Q9P1W9	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PALD1	Q9ULE6	856 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SEMA3E	O15041	775 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CIAO1	O76071	339 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TET3	O43151	1660 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TRAF5	O00463	557 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	STAM	Q92783	540 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GLG1	Q92896	1179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PRKAB2	O43741	272 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ERLIN1	O75477	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GDF11	O95390	407 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CNGA1	P29973	690 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	BIRC3	Q13489	604 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FANCB	Q8NB91	859 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	SYNM	O15061	1565 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	CACNB3	P54284	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	GSDMD	P57764	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870		H7C1W4	665 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	PLCD1	P51178	756 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-223	ENST00000621870	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

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