RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614239.1

LHX1-201, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX1, Length 3,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-201ENST00000614239 GRM8O00222 908 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.95■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PNOCQ13519 176 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KSR2Q6VAB6 950 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZNF827Q17R98 1081 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 A0A087WZG4 1122 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SRGAP2O75044 1071 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NLRP12P59046 1061 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SNCBQ16143 134 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RPS6KB1P23443 525 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 STAP2Q9UGK3 403 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TIMM10P62072 90 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PIP4K2BP78356 416 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 VSTM4Q8IW00 320 aa15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 STX17P56962 302 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KIFC2Q96AC6 838 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 DNA2P51530 1060 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TFCP2Q12800 502 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 DIP2AQ14689 1571 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.92■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SASH1O94885 1247 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SYKP43405 635 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CLIC4Q9Y696 253 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 BACH1O14867 736 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 HAND2P61296 217 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PSMB7Q99436 277 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 MCM8Q9UJA3 840 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 MYO1BO43795 1136 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PPFIA1Q13136 1202 aa15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 ARHGAP25P42331 645 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 EVI5LQ96CN4 794 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 STRN4Q9NRL3 753 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 KCND1Q9NSA2 647 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SPTLC2O15270 562 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 STX10O60499 249 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 NEK1Q96PY6 1258 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 JADE2Q9NQC1 790 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 MYO6Q9UM54 1294 aa15.9■□□□□ 0.14
LHX1-201ENST00000614239 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms