RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 EGFRP00533 1210 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 XAGE2Q96GT9 111 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 TLR3O15455 904 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 PDE4AP27815 886 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 TRDNQ13061 729 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.16□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L10C9JJH3 530 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 ERICH2A1L162 156 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 NFKBIBQ15653 356 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC102BQ68D86 513 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 SWAP70Q9UH65 585 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 COPRSQ9NQ92 184 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 CPA4Q9UI42 421 aa10.15□□□□□ -0.78
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L15C9J2P7 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L11C9JVI0 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L18D6R9N7 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L22D6RA61 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L19D6RCP7 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L20D6RJB6 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP17L24Q0WX57 530 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 GPR108Q9NPR9 543 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TAF1P21675 1872 aa10.15□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 GNAT2P19087 354 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 NOD1Q9Y239 953 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SCN9AQ15858 1988 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 DLK2Q6UY11 383 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TLR2O60603 784 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 FGD1P98174 961 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 VGLL4Q14135 290 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.14□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RAD50Q92878 1312 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SPP2Q13103 211 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MAP3K11Q16584 847 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MB21D1Q8N884 522 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MXD3Q9BW11 206 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 HIP1O00291 1037 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CRHR2Q13324 411 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SNRKQ9NRH2 765 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SRRDQ9UH36 339 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.13□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TFCP2Q12800 502 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MOB2Q70IA6 237 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 FSD1Q9BTV5 496 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 LRRC24Q50LG9 513 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 FBXO40Q9UH90 709 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 HMGCRP04035 888 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 ARMC5Q96C12 935 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CACNB3P54284 484 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 AAMPQ13685 434 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 NCAPG2Q86XI2 1143 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.12□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC96Q2M329 555 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 NAPBQ9H115 298 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 FOXO4P98177 505 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 FDX1P10109 184 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF248-208ENST00000611278 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms