RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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TRAPPC5-204ENST00000596148 TNNC1P63316 161 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRDM1O75626 825 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 BEND3Q5T5X7 828 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.64■■□□□ 1.22
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TRAPPC5-204ENST00000596148 H7C1D1 291 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC5-204ENST00000596148 GPR108Q9NPR9 543 aa22.64■■□□□ 1.22
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TRAPPC5-204ENST00000596148 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 CIAO1O76071 339 aa22.64■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 KRT40Q6A162 431 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP44Q9H0E7 712 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.64■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 USP40Q9NVE5 1235 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 DNM3Q9UQ16 869 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.64■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.63■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 IQCDQ96DY2 449 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.63■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.63■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 AZI2Q9H6S1 392 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 CHMP2AO43633 222 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 CSRNP2Q9H175 543 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 SEC24BO95487 1268 aa22.61■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 CBX1P83916 185 aa22.6■■□□□ 1.21
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TRAPPC5-204ENST00000596148 SIK1P57059 783 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 GTF2IP78347 998 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 LIN9Q5TKA1 542 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 DNM2P50570 870 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 NLRP12P59046 1061 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 PLCB3Q01970 1234 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC5-204ENST00000596148 PPM1EQ8WY54 764 aa22.6■■□□□ 1.21
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