RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	C8A	P07357	584 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	LRRC14	Q15048	493 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	CELA3A	P09093	270 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	EOMES	O95936	686 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ASB11	Q8WXH4	323 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM168A	Q92567	244 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	JAG1	P78504	1218 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNA1	Q09470	495 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	INPP5A	Q14642	412 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ZNF559-209	ENST00000591652	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	LRIG2	O94898	1065 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	SLITRK5	O94991	958 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	CLCN7	P51798	805 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	ZP2	Q05996	745 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	IKZF1	Q13422	519 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	HDX	Q7Z353	690 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	FBRS	Q9HAH7	460 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXQ1	Q9C009	403 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	CAP2	P40123	477 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	NKG7	Q16617	165 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	PRR33	A8MZF0	331 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	GNA15	P30679	374 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	CDK8	P49336	464 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF124	Q15973	351 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	HID1	Q8IV36	788 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	MIPEP	Q99797	713 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	GFRA2	O00451	464 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	FGD1	P98174	961 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ZNF559-209	ENST00000591652	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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