RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 CCL5P13501 91 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 GSTO1P78417 241 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 TNNI3KQ59H18 835 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 TEX11Q8IYF3 940 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.9□□□□□ -0.02
CTIF-208ENST00000590422 H0YGN5 161 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 LDHCP07864 332 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 RLBP1P12271 317 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ELNP15502 786 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SSH3Q8TE77 659 aa14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 GJA8P48165 433 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 FLT3LGP49771 235 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SPP2Q13103 211 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 RNF208Q9H0X6 261 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC18Q9H819 358 aa14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ADCY3O60266 1144 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 GJB1P08034 283 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 CAP2P40123 477 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 HMGCS2P54868 508 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 JAG1P78504 1218 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ATP8B2P98198 1209 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 GPR108Q9NPR9 543 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 FLT1P17948 1338 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PLXNB2O15031 1838 aa14.87□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SZT2Q5T011 3432 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 INHAP05111 366 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ZAP70P43403 619 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 UBXN2AP68543 259 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PNMA3Q9UL41 463 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 MYH1P12882 1939 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ALPK3Q96L96 1907 aa14.85□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 USP17L5A8MUK1 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PPP4CP60510 307 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 IRF5Q13568 498 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 MTMR2Q13614 643 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 PALD1Q9ULE6 856 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.84□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PEX10O60683 326 aa14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 BAG3O95817 575 aa14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PLCG2P16885 1265 aa14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 LAMA3Q16787 3333 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 GDF11O95390 407 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 SGPL1O95470 568 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CEP85Q6P2H3 762 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 DPF3Q92784 378 aa14.82□□□□□ -0.04
CTIF-208ENST00000590422 COA7Q96BR5 231 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms