RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NOX5Q96PH1 765 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 NUP58Q9BVL2 599 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TXKP42681 527 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF790Q6PG37 636 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 DTNBO60941 627 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 BIRC3Q13489 604 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SUCLG2Q96I99 432 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 MYL10Q9BUA6 226 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 IFT20Q8IY31 132 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 IFT74Q96LB3 600 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CA8P35219 290 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 POSTNQ15063 836 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 PHKBQ93100 1093 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 FNBP1Q96RU3 617 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 STMN2Q93045 179 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K9P80192 1104 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC14Q49A88 953 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 INF2Q27J81 1249 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ASXL2Q76L83 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 MTX1Q13505 466 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CSRNP2Q9H175 543 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SWAP70Q9UH65 585 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 JAK2O60674 1132 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KRT9P35527 623 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP6O43182 974 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 MAP2K2P36507 400 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 EYA3Q99504 573 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM1O75626 825 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 BEND3Q5T5X7 828 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KRT40Q6A162 431 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CHL1O00533 1208 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 NELFBQ8WX92 580 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KIF3CO14782 793 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CETN3O15182 167 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC169A6NNP5 214 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 HOXB7P09629 217 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 PDE8AO60658 829 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SBNO1A3KN83 1393 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CIB2O75838 187 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 SETSIPP0DME0 302 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf37Q96NL8 207 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 STX10O60499 249 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 SMTNP53814 917 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 FYB2Q5VWT5 728 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP25P42331 645 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 PNOCQ13519 176 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 LIN9Q5TKA1 542 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 UFL1O94874 794 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 DYMQ7RTS9 669 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 LGR6Q9HBX8 967 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
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