RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAG3O95817 575 aa34.59■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAET1EQ8TD07 263 aa34.59■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.58■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa34.58■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYPNQ86TC9 1320 aa34.57■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZAP70P43403 619 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FCGRTP55899 365 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MGAMO43451 1857 aa34.55■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa34.55■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADGRA1Q86SQ6 560 aa34.54■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAP2P40123 477 aa34.53■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa34.53■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PANK1Q8TE04 598 aa34.53■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa34.53■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PI4KBQ9UBF8 816 aa34.53■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRKCZQ05513 592 aa34.52■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPP2Q13103 211 aa34.52■■■■□ 3.12
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TREML2Q5T2D2 321 aa34.51■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF280CQ8ND82 737 aa34.51■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MTFR1Q15390 333 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TBC1D2Q9BYX2 928 aa34.5■■■■□ 3.11
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PNMA3Q9UL41 463 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FLT1P17948 1338 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIPA1L1O43166 1804 aa34.49■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGSF3O75054 1194 aa34.49■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L5A8MUK1 530 aa34.48■■■■□ 3.11
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AS3MTQ9HBK9 375 aa34.47■■■■□ 3.11
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PALD1Q9ULE6 856 aa34.46■■■■□ 3.11
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAOK2Q9UL54 1235 aa34.38■■■■□ 3.09
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