RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570055.5

DDX19B-216, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 4

Gene DDX19B, Length 556 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-216	ENST00000570055	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	LDHC	P07864	332 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	OSBP	P22059	807 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PSMC4	P43686	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PRMT2	P55345	433 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PPP4C	P60510	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	FLT1	P17948	1338 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	ZAP70	P43403	619 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	KIF22	Q14807	665 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23	8e-6	■■□□□ 11.4
DDX19B-216	ENST00000570055	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	RLF	Q13129	1914 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	JAG1	P78504	1218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	IGSF3	O75054	1194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	CAP2	P40123	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	MTFR1	Q15390	333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DDX19B-216	ENST00000570055	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	PLCG2	P16885	1265 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	FCGRT	P55899	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	GRK4	P32298	578 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	HMGCS2	P54868	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SPP2	Q13103	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.57	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	BAG3	O95817	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	AACS	Q86V21	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	CYP7A1	P22680	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	HOXD10	P28358	340 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	IRF5	Q13568	498 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	MTMR2	Q13614	643 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX19B-216	ENST00000570055	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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