RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	RAD50	Q92878	1312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	GNAT2	P19087	354 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	INPP5B	P32019	993 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HUNK	P57058	714 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HAND2	P61296	217 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PTH1R	Q03431	593 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CTR9	Q6PD62	1173 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	NAPB	Q9H115	298 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DNAJC18	Q9H819	358 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	SGSM2	O43147	1006 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	GDF11	O95390	407 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HSPA6	P17066	643 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PTPRF	P10586	1907 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	MYH4	Q9Y623	1939 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	PPARA	Q07869	468 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	VGLL4	Q14135	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	PRDM1	O75626	825 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	FGA	P02671	866 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	SHMT1	P34896	483 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	JAG1	P78504	1218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	KLRG1	Q96E93	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	TBC1D12	O60347	775 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	CDK8	P49336	464 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	FKBP1B	P68106	108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	GABPA	Q06546	454 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	ALX1	Q15699	326 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	EHD4	Q9H223	541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL4-208	ENST00000564744	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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