RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CCP110O43303 1012 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 IGHA1P01876 353 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PSMA3P25788 255 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 HOXC13P31276 330 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MAGEA8P43361 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ZBED6P86452 979 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 FOXK2Q01167 660 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM29Q14134 588 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 WASHC4Q2M389 1173 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CTR9Q6PD62 1173 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.47□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.47□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 DDB1Q16531 1140 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 PHC3Q8NDX5 983 aa6.46□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TEKT1Q969V4 418 aa6.46□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 MSTNO14793 375 aa6.45□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 NOS2P35228 1153 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 SMTNP53814 917 aa6.45□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 USP48Q86UV5 1035 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 FERMT3Q86UX7 667 aa6.45□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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CAPN3-211ENST00000562199 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.44□□□□□ -1.38
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