RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.54■□□□□ 0.88
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LGMN-216ENST00000557434 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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LGMN-216ENST00000557434 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.53■□□□□ 0.88
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LGMN-216ENST00000557434 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.52■□□□□ 0.88
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LGMN-216ENST00000557434 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.51■□□□□ 0.87
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LGMN-216ENST00000557434 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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LGMN-216ENST00000557434 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.45■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 GGA3Q9NZ52 723 aa20.45■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 APOBRQ0VD83 1088 aa20.44■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.44■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.44■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.44■□□□□ 0.86
LGMN-216ENST00000557434 MCM2P49736 904 aa20.44■□□□□ 0.86
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