RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 CBX8Q9HC52 389 aa7.48□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.48□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.48□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.48□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.47□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.47□□□□□ -1.21
PRPF39-210ENST00000556718 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.47□□□□□ -1.21
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PRPF39-210ENST00000556718 C12orf40Q86WS4 652 aa7.46□□□□□ -1.22
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PRPF39-210ENST00000556718 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 TREHO43280 583 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 CELA3AP09093 270 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 GSTT1P30711 240 aa7.35□□□□□ -1.23
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