RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNMA3Q9UL41 463 aa23.82■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM196BA6NMK8 535 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H0YGN5 161 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADCY3O60266 1144 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLT3LGP49771 235 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPP2Q13103 211 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX11Q8IYF3 940 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAG3O95817 575 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAP2P40123 477 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRF5Q13568 498 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLA2Q14181 598 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP290O15078 2479 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DOCK1Q14185 1865 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP8B2P98198 1209 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TREML2Q5T2D2 321 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSH3Q8TE77 659 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPF3Q92784 378 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.79■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP17L5A8MUK1 530 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGSF3O75054 1194 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLCG2P16885 1265 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAPN2P17655 700 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP4CP60510 307 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNNI3KQ59H18 835 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COA7Q96BR5 231 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNRKQ9NRH2 765 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.78■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RLBP1P12271 317 aa23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.77■■□□□ 1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGPL1O95470 568 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELNP15502 786 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGAMO43451 1857 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRFP10586 1907 aa23.76■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INHAP05111 366 aa23.75■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGCS2P54868 508 aa23.75■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR18Q9BV38 432 aa23.75■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASNSP08243 561 aa23.73■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.73■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GINM1Q9NU53 330 aa23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.72■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.71■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB118Q96PH6 123 aa23.71■■□□□ 1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZAP70P43403 619 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BACE1P56817 501 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.7■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLT1P17948 1338 aa23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C19orf81C9J6K1 198 aa23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PANK1Q8TE04 598 aa23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PALD1Q9ULE6 856 aa23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms