RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 PTPRAP18433 802 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 DNAJC18Q9H819 358 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 BTBD19C9JJ37 291 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CAPN15O75808 1086 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 MOGSQ13724 837 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 PICK1Q9NRD5 415 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 PALD1Q9ULE6 856 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 FKTNO75072 461 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ADD2P35612 726 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CHGBP05060 677 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CXCL11O14625 94 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CAP2P40123 477 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 USP5P45974 858 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 LCORLQ8N3X6 602 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 MYH8P13535 1937 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 AAMPQ13685 434 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 GPATCH3Q96I76 525 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 HLA-DOAP06340 250 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-219ENST00000550655 JAG1P78504 1218 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 EHD4Q9H223 541 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ARMT1Q9H993 441 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 MBD4O95243 580 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 CAP1Q01518 475 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 UBE3CQ15386 1083 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 GCC1Q96CN9 775 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TRIM75PA6NK02 468 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PDHXO00330 501 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TLR2O60603 784 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 SP3Q02447 781 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 MGAMO43451 1857 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 HTTP42858 3142 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 GDF11O95390 407 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PLCD1P51178 756 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 EVX2Q03828 476 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ERO1AQ96HE7 468 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 USP17L5A8MUK1 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PRKAB2O43741 272 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 MX1P20591 662 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 TTC6Q86TZ1 520 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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CS-219ENST00000550655 ASNSP08243 561 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 GABPAQ06546 454 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 GINM1Q9NU53 330 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-219ENST00000550655 ERC2O15083 957 aa21.39■■□□□ 1.01
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