RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	USP48	Q86UV5	1035 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	DPF2	Q92785	391 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	COA1	Q9GZY4	146 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	SIL1	Q9H173	461 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	EYA2	O00167	538 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	IL1R1	P14778	569 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ADORA1	P30542	326 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	SCARF1	Q14162	830 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MDM2-234	ENST00000546048		F8W031	263 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048		H7C1D1	291 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SASH1	O94885	1247 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	PDE8B	O95263	885 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L8	P0C7I0	530 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	KCNJ4	P48050	445 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	VEGFB	P49765	207 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	UBE4A	Q14139	1066 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	METTL24	Q5JXM2	366 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	MOB2	Q70IA6	237 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ZIC5	Q96T25	663 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	FZD1	Q9UP38	647 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	KIF16B	Q96L93	1317 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	WNT10B	O00744	389 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SRGAP3	O43295	1099 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	TIMM10	P62072	90 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	TFCP2	Q12800	502 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	MTX1	Q13505	466 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	GGA3	Q9NZ52	723 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SPEF2	Q9C093	1822 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CACNA1F	O60840	1977 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	GNAI2	P04899	355 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	BMP1	P13497	986 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	PHKA1	P46020	1223 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ATP8B2	P98198	1209 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	COG6	Q9Y2V7	657 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SCN4A	P35499	1836 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF609	O15014	1411 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CNTNAP1	P78357	1384 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CLRN2	A0PK11	232 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	AOC2	O75106	756 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CIAO1	O76071	339 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	GNAI3	P08754	354 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MDM2-234	ENST00000546048	CEP85	Q6P2H3	762 aa		6.3	□□□□□ -1.4

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