RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536244.5

KCTD20-210, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene KCTD20, Length 5,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20-210ENST00000536244 BACH1O14867 736 aa20.25■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 TTC38Q5R3I4 469 aa20.25■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.25■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 APPBP2Q92624 585 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 MBD4O95243 580 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 GIPC1O14908 333 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF131P52739 623 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 P3H4Q92791 437 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PLCH2O75038 1416 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 CEP104O60308 925 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 CNGA1P29973 690 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 GEN1Q17RS7 908 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 DCAF5Q96JK2 942 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.24■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF853P0CG23 659 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PLIN2Q99541 437 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 EYA2O00167 538 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SGSM2O43147 1006 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SH3BP5O60239 455 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SLC39A6Q13433 755 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 BCRP11274 1271 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.23■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 GNA14O95837 355 aa20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 POSTNQ15063 836 aa20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 F8W031 263 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 TTC16Q8NEE8 873 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 RXRAP19793 462 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.831e-6■■□□□ 12.3
KCTD20-210ENST00000536244 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 NESP48681 1621 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 PLS1Q14651 629 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.21■□□□□ 0.83
KCTD20-210ENST00000536244 DENND2CQ68D51 928 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TSPYL6Q8N831 410 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM58Q8NG06 486 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TNNI3KQ59H18 835 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 PEX26Q7Z412 305 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 MSH6P52701 1360 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 RASA3Q14644 834 aa20.2■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 B4E1Z4 1266 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 STRN3Q13033 797 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 KRT71Q3SY84 523 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 ATP2A3Q93084 1043 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 SEC24BO95487 1268 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 EPSTI1Q96J88 318 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 APBA1Q02410 837 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 CHRNA2Q15822 529 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TNRQ92752 1358 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 NPATQ14207 1427 aa20.19■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 KRT15P19012 456 aa20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 PARP10Q53GL7 1025 aa20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 SIRT1Q96EB6 747 aa20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
KCTD20-210ENST00000536244 TAF12Q16514 161 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms