RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	TCP10	Q12799	353 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ALX1	Q15699	326 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ZMYM6	O95789	1325 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	SGSM2	O43147	1006 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	SKAP1	Q86WV1	359 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.22	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	CACNB3	P54284	484 aa		18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	NFIA	Q12857	509 aa		18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	SBK1	Q52WX2	424 aa		18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	EHD4	Q9H223	541 aa		18.21	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TBC1D12	O60347	775 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SLC10A3	P09131	477 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CDCA5	Q96FF9	252 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SWAP70	Q9UH65	585 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		18.2	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RNF20	Q5VTR2	975 aa		18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	GINM1	Q9NU53	330 aa		18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		18.19	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		18.18	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MYH1	P12882	1939 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	USP17L12	C9JPN9	530 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	USP17L21	D6R901	530 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PDE4B	Q07343	736 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	C12orf60	Q5U649	245 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.17	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF213	O14771	459 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PRKAB2	O43741	272 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TRPA1	O75762	1119 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CHGB	P05060	677 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MCC	P23508	829 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PALD1	Q9ULE6	856 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		18.16	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	FGA	P02671	866 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MAP3K10	Q02779	954 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CTR9	Q6PD62	1173 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC17	Q96LX7	622 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		18.15	■□□□□ 0.5
BBS1-224	ENST00000534730	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CSAD	Q9Y600	493 aa		18.14	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SOX10	P56693	466 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PPARA	Q07869	468 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TRDN	Q13061	729 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.13	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	VPS53	Q5VIR6	699 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		18.12	■□□□□ 0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms