RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 EHD4Q9H223 541 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 RASEFQ8IZ41 740 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 E7EWF7 191 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 TRDNQ13061 729 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 TEPSINQ96N21 525 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 SWAP70Q9UH65 585 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 MYH8P13535 1937 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 SIPA1L1O43166 1804 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 PSMA5P28066 241 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 NBPF3Q9H094 633 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-215ENST00000532308 TBC1D12O60347 775 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 FGRP09769 529 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 POTEIP0CG38 1075 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 POTEJP0CG39 1038 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 CDK8P49336 464 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NT5C2P49902 561 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 EVX2Q03828 476 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 GABPAQ06546 454 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 USP48Q86UV5 1035 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NCOA7Q8NI08 942 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 IL17RAQ96F46 866 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 KRT23Q9C075 422 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 SMIM22K7EJ46 135 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 YY1P25490 414 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NEK1Q96PY6 1258 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 TOMM22Q9NS69 142 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 ADM5C9JUS6 153 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 ORC4O43929 436 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 DCAF15Q66K64 600 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 MAP3K10Q02779 954 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 INCENPQ9NQS7 918 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NF2P35240 595 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 ESR2Q92731 530 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 NEDD4P46934 1319 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 PRDM1O75626 825 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 CHADLQ6NUI6 762 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 CDCA5Q96FF9 252 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-215ENST00000532308 B4E1Z4 1266 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 SHMT1P34896 483 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC17Q96LX7 622 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 DNAJC18Q9H819 358 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 FAM196BA6NMK8 535 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 RASA1P20936 1047 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 IL27Q8NEV9 243 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 KIF2CQ99661 725 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 TSPY2A6NKD2 308 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 KIF3CO14782 793 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 KDM4AO75164 1064 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 MCM5P33992 734 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 RABEP1Q15276 862 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 RUFY3Q7L099 469 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-215ENST00000532308 TSPY3P0CV98 308 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms