RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA4Q9UN74 947 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FANCGO15287 622 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPK1P28482 360 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFMP43652 599 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLCN7P51798 805 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE4CQ08493 712 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBLN7Q53RD9 439 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 RETREG2Q8NC44 543 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCT2Q8NC54 265 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXQ1Q9C009 403 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAGE1O75459 146 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM37O94972 964 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAP1GAPP47736 663 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MESP2Q0VG99 397 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC14Q15048 493 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENC1O14682 589 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 EOMESO95936 686 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMP6P22004 513 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTF4P34130 210 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPK8P45983 427 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FYB2Q5VWT5 728 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIRREL1Q96J84 757 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOX2Q96NM4 488 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRIG2O94898 1065 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLI1P08151 1106 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGD1P98174 961 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 DSC3Q14574 896 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD4AQ8N468 514 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIPEPQ99797 713 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR33A8MZF0 331 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BS24 57 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TREHO43280 583 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RING1Q06587 406 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE4AQ5TA78 99 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASIP1Q5U651 963 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDXQ7Z353 690 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLITRK5O94991 958 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPAN15O95858 294 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBX7O95931 251 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELA3AP09093 270 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP2B2Q01814 1243 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBF1Q8TES7 1133 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIRC2Q96SL1 478 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBRSQ9HAH7 460 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMNB1P20700 586 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFPP27918 469 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 INPP5AQ14642 412 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC120Q96HB5 630 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SETDB2Q96T68 719 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms