RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPFIA2O75334 1257 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ONECUT2O95948 504 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTSBP07858 339 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP10-9P60411 292 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSRP2Q16527 193 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNKSR3Q6P9H4 555 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q8N1X5 172 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 NLGN1Q8N2Q7 840 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ABTB2Q8N961 1025 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PANK1Q8TE04 598 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 HHIPQ96QV1 700 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 USP40Q9NVE5 1235 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SIRT5Q9NXA8 310 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM63CQ9P1W3 806 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR14I1A6ND48 311 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACPPP15309 386 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCSK2P16519 638 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LMO1P25800 156 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDE6BP35913 854 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZAP70P43403 619 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTLL4Q14679 1199 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 C16orf46Q6P387 395 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPPL2CQ8IUH8 684 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 MFSD4AQ8N468 514 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTC16Q8NEE8 873 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 COX4I2Q96KJ9 171 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SGPP1Q9BX95 441 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DISC1Q9NRI5 854 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRT82Q9NSB4 513 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNTN3Q9P232 1028 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRPA1O75762 1119 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 B3GALT4O96024 378 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 HK2P52789 917 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR152Q8TDT2 470 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 VWCEQ96DN2 955 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ABLIM1O14639 778 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHRNEQ04844 493 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF423Q2M1K9 1284 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM129CQ86XR2 697 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF214Q8ND24 703 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC25Q9H1X3 360 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A096LPE4 126 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PPZ6 126 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 H3BS24 57 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLURP1P55000 103 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERVFC1P60507 584 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERVK-24P63145 666 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DPYDQ12882 1025 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTK7Q13308 1070 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 VMACQ2NL98 169 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 RALGPS1Q5JS13 557 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKMY2Q8IV38 441 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHST13Q8NET6 341 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ISL2Q96A47 359 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PWWP2AQ96N64 755 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS11Q9H270 941 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 GGNBP2Q9H3C7 697 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SP110Q9HB58 689 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST14Q9Y5Y6 855 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PP55 124 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM196BA6NMK8 535 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 EOMESO95936 686 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIR3DL1P43629 444 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SFRP5Q5T4F7 317 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDKAL1Q5VV42 579 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 BHLHA9Q7RTU4 235 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCUBE1Q8IWY4 988 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCT2Q8NC54 265 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBE2FQ969M7 185 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOXL4Q96JB6 756 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 C8orf49Q96NF6 230 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF747Q9BV97 191 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 STIM2Q9P246 746 aa2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms