RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-397P-201ENST00000516226 PICK1Q9NRD5 415 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-397P-201ENST00000516226 GIPC1O14908 333 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD96P40200 585 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBF1Q8TES7 1133 aa4.58□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 U3KQE9 123 aa4.58□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 MLANAQ16655 118 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKLE2Q86XL3 938 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIRREL1Q96J84 757 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 CAP2P40123 477 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBX8Q9HC52 389 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 NFIBO00712 420 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 EOMESO95936 686 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 NTF4P34130 210 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 PPM1JQ5JR12 505 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD4AQ8N468 514 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAC2P15153 192 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP7A1P22680 504 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIR3DL1P43629 444 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 LCE4AQ5TA78 99 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 STK35Q8TDR2 534 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 CARNS1A5YM72 827 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 ENC1O14682 589 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 TREHO43280 583 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 BMP6P22004 513 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLCB3Q01970 1234 aa4.53□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TMC7Q7Z402 723 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-397P-201ENST00000516226 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.53□□□□□ -1.68
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RNU6-397P-201ENST00000516226 CFPP27918 469 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 DSC3Q14574 896 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.52□□□□□ -1.69
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.52□□□□□ -1.69
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RNU6-397P-201ENST00000516226 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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RNU6-397P-201ENST00000516226 SLITRK5O94991 958 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 MED14OSP0DP75 135 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRFP11831 508 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 GLDCP23378 1020 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 PI16Q6UXB8 463 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1QL4Q86Z23 238 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 HID1Q8IV36 788 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 FRMD6Q96NE9 622 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPG7Q9UQ90 795 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM253P0C7T8 217 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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