RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FSIP1Q8NA03 581 aa6.65□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.65□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 MRIQ9BWK5 157 aa6.65□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.65□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SERPINC1P01008 464 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.65□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 MEGF6O75095 1541 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PPARAQ07869 468 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CCDC96Q2M329 555 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 KRT79Q5XKE5 535 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 IFNAR1P17181 557 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CHRNDQ07001 517 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 USP48Q86UV5 1035 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NEK9Q8TD19 979 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PLVAPQ9BX97 442 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 MAP9Q49MG5 647 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ADALQ6DHV7 355 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 DCAF4Q8WV16 495 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CDHR1Q96JP9 859 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 E7EWF7 191 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ARHGEF6Q15052 776 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.64□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 AP3B2Q13367 1082 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NECTIN1Q15223 517 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 AFF2P51816 1311 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 IGKV5-2P06315 115 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CDC25BP30305 580 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ANO1Q5XXA6 986 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FAM177BA6PVY3 158 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SERPINB2P05120 415 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 FBLN1P23142 703 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 APOBRQ0VD83 1088 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.351e-6■□□□□ 10.7
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 STK17AQ9UEE5 414 aa6.63□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SYT1P21579 422 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CMA1P23946 247 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 SNX16P57768 344 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 KRT24Q2M2I5 525 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 TKFCQ3LXA3 575 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 EXOC1Q9NV70 894 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 PHLPP1O60346 1717 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.62□□□□□ -1.35
POLK-215ENST00000514141 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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