RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 APBA2Q99767 749 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 USP44Q9H0E7 712 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 USP40Q9NVE5 1235 aa9.62□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 F8W031 263 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 E9PSI1 815 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 DNM1LO00429 736 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.61□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 ATP2B3Q16720 1220 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC24Q50LG9 513 aa9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 ASNSP08243 561 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-210ENST00000503258 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-210ENST00000503258 CCNA1P78396 465 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 TRIB2Q92519 343 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 USP17L15C9J2P7 530 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 USP17L18D6R9N7 530 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-210ENST00000503258 USP17L19D6RCP7 530 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L20D6RJB6 530 aa9.55□□□□□ -0.88
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