RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PALD1Q9ULE6 856 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DOCK1Q14185 1865 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGSF3O75054 1194 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHGBP05060 677 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CETPP11597 493 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAP3K10Q02779 954 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRHR2Q13324 411 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPATCH3Q96I76 525 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYH1P12882 1939 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SIPA1L1O43166 1804 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBC1D12O60347 775 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYH7P12883 1935 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BTBD19C9JJ37 291 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FKTNO75072 461 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPRAP18433 802 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LCORLQ8N3X6 602 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABHD8Q96I13 439 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARMT1Q9H993 441 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HLA-DOAP06340 250 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADD2P35612 726 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CERS3Q8IU89 383 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM75PA6NK02 468 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MBD4O95243 580 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CAP2P40123 477 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DNAJC18Q9H819 358 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRKAB2O43741 272 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDHXO00330 501 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CXCL11O14625 94 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GDF11O95390 407 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGHDP01880 384 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 JAG1P78504 1218 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EVX2Q03828 476 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MOGSQ13724 837 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GCC1Q96CN9 775 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPRFP10586 1907 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USP17L5A8MUK1 530 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERC2O15083 957 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NEFLP07196 543 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP2D6P10635 497 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MX1P20591 662 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLCD1P51178 756 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SP3Q02447 781 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPP2Q13103 211 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBE3CQ15386 1083 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTC6Q86TZ1 520 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMC5Q8IY18 1101 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.59□□□□□ -0.07
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms