RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC3Q9BY71 257 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 RAXQ9Y2V3 346 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 NTF4P34130 210 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 PAK2Q13177 524 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 REC114Q7Z4M0 266 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 ISL2Q96A47 359 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 STOML1Q9UBI4 398 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-215ENST00000498284 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GRK4P32298 578 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 MAP7Q14244 749 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 NFKBIBQ15653 356 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 SEZ6Q53EL9 994 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PAOXQ6QHF9 649 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 NKD1Q969G9 470 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 HMX2A2RU54 273 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 TNNI2P48788 182 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 LGR6Q9HBX8 967 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GRIN3BO60391 1043 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 MCM4P33991 863 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GJA8P48165 433 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PDE4BQ07343 736 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 KCT2Q8NC54 265 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GPRASP2Q96D09 838 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PGRP06401 933 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 FURINP09958 794 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 HID1Q8IV36 788 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 SPATA32Q96LK8 384 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 FBRSQ9HAH7 460 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 CAPN10Q9HC96 672 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 DYRK3O43781 588 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 HTR3BO95264 441 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PLCG1P19174 1290 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF165P49910 485 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 RNF43Q68DV7 783 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ATE1O95260 518 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 CLCQ05315 142 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 NKG7Q16617 165 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GK5Q6ZS86 529 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GINM1Q9NU53 330 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 FSTP19883 344 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 CAP2P40123 477 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 NFIAQ12857 509 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM87BQ96K49 555 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 TINF2Q9BSI4 451 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-215ENST00000498284 GSC2O15499 205 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 LRIG2O94898 1065 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 IGLV1-40P01703 118 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 ADMP35318 185 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 CDK5R2Q13319 367 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A19Q695T7 634 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-215ENST00000498284 GATA6Q92908 595 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms