RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.71■□□□□ 0.91
USP20-208ENST00000494971 PICK1Q9NRD5 415 aa20.71■□□□□ 0.91
USP20-208ENST00000494971 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.71■□□□□ 0.91
USP20-208ENST00000494971 FAM196BA6NMK8 535 aa20.7■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 CXCL11O14625 94 aa20.7■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.7■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 BTBD19C9JJ37 291 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 MOGSQ13724 837 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 PALD1Q9ULE6 856 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.69■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 MYH1P12882 1939 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ADD2P35612 726 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 GPATCH3Q96I76 525 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 DNAJC18Q9H819 358 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 MYH7P12883 1935 aa20.68■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 CAP2P40123 477 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 USP5P45974 858 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 44
USP20-208ENST00000494971 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.67■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 PTPRFP10586 1907 aa20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 HLA-DOAP06340 250 aa20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 UBE3CQ15386 1083 aa20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 CAPN15O75808 1086 aa20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 GCC1Q96CN9 775 aa20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 EHD4Q9H223 541 aa20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
USP20-208ENST00000494971 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.64■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 LCORLQ8N3X6 602 aa20.64■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GINM1Q9NU53 330 aa20.64■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.64■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TLR2O60603 784 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SP3Q02447 781 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ERO1AQ96HE7 468 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.63■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PDHXO00330 501 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CHGBP05060 677 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TTC6Q86TZ1 520 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.62■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 USP17L5A8MUK1 530 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 MBD4O95243 580 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ASNSP08243 561 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ARMT1Q9H993 441 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TRIM75PA6NK02 468 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ERC2O15083 957 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 JAG1P78504 1218 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 WDR18Q9BV38 432 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.6■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 HTTP42858 3142 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 MX1P20591 662 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PLCD1P51178 756 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CAP1Q01518 475 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GABPAQ06546 454 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SPP2Q13103 211 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 C17orf99Q6UX52 265 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms