RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494546.1

CBX4-203, Transcript of chromobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene CBX4, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-203ENST00000494546 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 ANKRD23Q86SG2 305 aa40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 DCTPP1Q9H773 170 aa40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 PALD1Q9ULE6 856 aa40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 HPS5Q9UPZ3 1129 aa40.33■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 ATP5JP18859 108 aa40.32■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 USP5P45974 858 aa40.32■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa40.32■■■■■ 4.05
CBX4-203ENST00000494546 DOCK1Q14185 1865 aa40.32■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 PDE6AP16499 860 aa40.31■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 MOGSQ13724 837 aa40.31■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 PDHXO00330 501 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 OTOP1Q7RTM1 612 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 PAG1Q9NWQ8 432 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa40.3■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 TLR2O60603 784 aa40.29■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 TRIM34Q9BYJ4 488 aa40.29■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 FOCADQ5VW36 1801 aa40.28■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 TRIM75PA6NK02 468 aa40.28■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 ZNF532Q9HCE3 1301 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 HLA-DOAP06340 250 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 CAP2P40123 477 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 CRBNQ96SW2 442 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 HAUS7Q99871 368 aa40.27■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 EFCC1Q9HA90 598 aa40.26■■■■■ 4.04
CBX4-203ENST00000494546 GPAT2Q6NUI2 795 aa40.25■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 GADL1Q6ZQY3 521 aa40.25■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 SIPA1L1O43166 1804 aa40.25■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 DNAJC18Q9H819 358 aa40.24■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 CAP1Q01518 475 aa40.23■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 ECHDC1Q9NTX5 307 aa40.22■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 CPA4Q9UI42 421 aa40.22■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa40.21■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 PHIPQ8WWQ0 1821 aa40.21■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 SPP2Q13103 211 aa40.2■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 ARHGEF6Q15052 776 aa40.2■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CBX4-203ENST00000494546 USP17L5A8MUK1 530 aa40.19■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 C17orf99Q6UX52 265 aa40.19■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ZNF280CQ8ND82 737 aa40.19■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 PTPN22Q9Y2R2 807 aa40.19■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 CYP2C8P10632 490 aa40.18■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 SOX10P56693 466 aa40.18■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 KIF22Q14807 665 aa40.18■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 GPATCH3Q96I76 525 aa40.18■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 TBC1D2Q9BYX2 928 aa40.18■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ATAD5Q96QE3 1844 aa40.17■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ADD2P35612 726 aa40.17■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 SLFNL1Q499Z3 407 aa40.17■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 MYH1P12882 1939 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 GDF11O95390 407 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ASNSP08243 561 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 TTC6Q86TZ1 520 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 LCORLQ8N3X6 602 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 AS3MTQ9HBK9 375 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ADGRA2Q96PE1 1338 aa40.16■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 JAG1P78504 1218 aa40.15■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 TSHZ3Q63HK5 1081 aa40.15■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 ARMT1Q9H993 441 aa40.15■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 SERPINB13Q9UIV8 391 aa40.15■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CBX4-203ENST00000494546 PTPRFP10586 1907 aa40.13■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 SDR42E1Q8WUS8 393 aa40.13■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 EHD4Q9H223 541 aa40.13■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa40.13■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa40.13■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 MBD4O95243 580 aa40.12■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 CHGBP05060 677 aa40.12■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 RGS19P49795 217 aa40.12■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 HMGCS2P54868 508 aa40.12■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 TREML2Q5T2D2 321 aa40.11■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 MCM9Q9NXL9 1143 aa40.11■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa40.11■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 PLCD1P51178 756 aa40.1■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa40.1■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 GINM1Q9NU53 330 aa40.1■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 UBE3CQ15386 1083 aa40.09■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 WDR18Q9BV38 432 aa40.09■■■■■ 4.01
CBX4-203ENST00000494546 TATDN1Q6P1N9 297 aa40.08■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms