RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 PAPLNO95428 1278 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 CELA3AP09093 270 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 USP17L7P0C7H9 530 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 NTF4P34130 210 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 CD96P40200 585 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 RASIP1Q5U651 963 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 SV2BQ7L1I2 683 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 HDXQ7Z353 690 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 ASB11Q8WXH4 323 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 LRIG2O94898 1065 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 INPP5AQ14642 412 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 EOMESO95936 686 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 GNA15P30679 374 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 FGD1P98174 961 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 LMNB1P20700 586 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 IKZF1Q13422 519 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 FOXQ1Q9C009 403 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 CLCN7P51798 805 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 FAM168AQ92567 244 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 AK5Q9Y6K8 562 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 SLITRK5O94991 958 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 C8AP07357 584 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 ZP2Q05996 745 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 FZD5Q13467 585 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 HOMEZQ8IX15 550 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 FBRSQ9HAH7 460 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NELFCD-210ENST00000490205 CAP2P40123 477 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 HID1Q8IV36 788 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 MIPEPQ99797 713 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 GRK4P32298 578 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 CDK8P49336 464 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 NKG7Q16617 165 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 MFSD4AQ8N468 514 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 CYP7A1P22680 504 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 SEPT6Q14141 434 aa6.43□□□□□ -1.38
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms