RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489994.5

IFRD1-215, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IFRD1, Length 1,721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-215ENST00000489994 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NAT2P11245 290 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CENPCQ03188 943 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 BACH2Q9BYV9 841 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ROCK1Q13464 1354 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 KIF1AQ12756 1690 aa6.51□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SLC35F4A4IF30 521 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 PPFIA2O75334 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 INHAP05111 366 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TGFB3P10600 412 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 IGFBP4P22692 258 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 GDF10P55107 478 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RASSF7Q02833 373 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC174Q6PII3 467 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TMC7Q7Z402 723 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TTC30AQ86WT1 665 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 KCNB2Q92953 911 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 KLF15Q9UIH9 416 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SUFUQ9UMX1 484 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FOXO3O43524 673 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FOSL1P15407 271 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 GUCY2CP25092 1073 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 WDR44Q5JSH3 913 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF358Q9NW07 568 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 STK17AQ9UEE5 414 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 HFM1A2PYH4 1435 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RAD50Q92878 1312 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CHD4Q14839 1912 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TPPPO94811 219 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RHOQP17081 205 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 MAN1A1P33908 653 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ITGAEP38570 1179 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SCNN1DP51172 638 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 POU4F2Q12837 409 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TLR1Q15399 786 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ZSCAN26Q16670 478 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF394Q53GI3 561 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 GNASQ5JWF2 1037 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SOGA3Q5TF21 947 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 C17orf50Q8WW18 174 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.49□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 DYNC1I1O14576 645 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 BACH1O14867 736 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 CD53P19397 219 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 ITGA6P23229 1130 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 MPSTP25325 297 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 LCA5Q86VQ0 697 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NBPF15Q8N660 670 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 MRS2Q9HD23 443 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 NAIPQ13075 1403 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 RREB1Q92766 1687 aa6.48□□□□□ -1.37
IFRD1-215ENST00000489994 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms