RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf37Q96NL8 207 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 PIDD1Q9HB75 910 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GINM1Q9NU53 330 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP3P12645 472 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 MCM4P33991 863 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 NTF4P34130 210 aa5.23□□□□□ -1.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 UVSSAQ2YD98 709 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GK5Q6ZS86 529 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF214Q8ND24 703 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ISL2Q96A47 359 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53INP1Q96A56 240 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 MYRFLQ96LU7 910 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 FANCGO15287 622 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 RXRBP28702 533 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 GRK4P32298 578 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCQ05315 142 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 FBRSQ9HAH7 460 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 LGR6Q9HBX8 967 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-211ENST00000489450 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 HTR3BO95264 441 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PGRP06401 933 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCG1P19174 1290 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF165P49910 485 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PPT2Q9UMR5 302 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJA2O60884 412 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 NFICP08651 508 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX9P48436 509 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ARID5AQ03989 594 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE4BQ07343 736 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 NKG7Q16617 165 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS37DQ86XT2 251 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA32Q96LK8 384 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ATE1O95260 518 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FGRP09769 529 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 NFKBIBQ15653 356 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 BEND4Q6ZU67 534 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.581e-33■□□□□ 9.2
RABGGTB-211ENST00000489450 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL3Q9UH77 587 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 HMX2A2RU54 273 aa5.18□□□□□ -1.58
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