RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 GABPAQ06546 454 aa27.89■■■□□ 2.06
GTPBP1-212ENST00000488787 DCAF15Q66K64 600 aa27.89■■■□□ 2.06
GTPBP1-212ENST00000488787 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
GTPBP1-212ENST00000488787 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.89■■■□□ 2.06
GTPBP1-212ENST00000488787 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.89■■■□□ 2.06
GTPBP1-212ENST00000488787 PPARAQ07869 468 aa27.88■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.88■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SMIM22K7EJ46 135 aa27.87■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.87■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SLURP2P0DP57 97 aa27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CST9Q5W186 159 aa27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 LAMB1P07942 1786 aa27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.86■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 DNAJC18Q9H819 358 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SWAP70Q9UH65 585 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.85■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF213O14771 459 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 FKBP1BP68106 108 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 NECTIN1Q15223 517 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 MAP3K11Q16584 847 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.84■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 CDK8P49336 464 aa27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 USP26Q9BXU7 913 aa27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM196BA6NMK8 535 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 SEC24BO95487 1268 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 HAND2P61296 217 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 PRKG1Q13976 671 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 KLRG1Q96E93 195 aa27.82■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 LAMA4Q16363 1823 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 FGRP09769 529 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 SHMT1P34896 483 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 NBPF3Q9H094 633 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 FZD1Q9UP38 647 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.81■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 CYP21A2P08686 494 aa27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 PDE4BQ07343 736 aa27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.8■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 MAP3K9P80192 1104 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 MOB2Q70IA6 237 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 UNCXA6NJT0 531 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC27A2O14975 620 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 PCP11498 1178 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 TBC1D10CQ8IV04 446 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 STK11IPQ8N1F8 1099 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 STAG1Q8WVM7 1258 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 KCNB2Q92953 911 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 WRNIP1Q96S55 665 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 ORC4O43929 436 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 HSPA4P34932 840 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 RNF20Q5VTR2 975 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 INCENPQ9NQS7 918 aa27.77■■■□□ 2.04
GTPBP1-212ENST00000488787 INPP5BP32019 993 aa27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 CAP2P40123 477 aa27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC17Q96LX7 622 aa27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 BACH2Q9BYV9 841 aa27.76■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 RASA1P20936 1047 aa27.75■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 APLP1P51693 650 aa27.75■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.75■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.75■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
GTPBP1-212ENST00000488787 GINM1Q9NU53 330 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms